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        -lncRNA和mRNA共表达分析

        Demo结果

         

        Demo结果解读

        网络图为筛选出的核心基因之间的关系,通过图论的方法计算出关键lncRNA与mRNA,并通过关键lncRNA的共表达mRNA预测出其功能。

         

        lncRNA和mRNA共表达分析介绍

        共表达网络图(Coexpression Network)是根据基因表达信号值的动态变化,计算基因间的共表达关系,得到基因间的表达调控关系及调控方向,从而构建基因的表达调控网络。通过研究lncRNA与mRNA的共表达关系,研究者可通过分析lncRNA调控能力,获得样本随实验变化的核心调控lncRNA。

         

        分析要求

        每组数据3个或3个以上生物学重复,每个样本均含有lncRNA与mRNA数据,差异基因或者关注的部分基因。

         

        提供结果

        1. 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
        2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
        3. 文本文件:基因之间共表达相关性以及显著性,lncRNA,mRNA核心共表达的排序。
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