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        细胞功能预测和信号通路研究工具箱

        背景介绍

        基因功能预测工具

        在筛选出有意义的基因并对其进行验证之后,可以对这些基因进行功能预测,以使后续的功能研究实验更有的放矢。伯豪自主开发的基因功能预测工具,可对非编码RNA与miRNA、非编码RNA与蛋白/转录因子、ceRNA、下游靶基因/相互作用基因等,进行功能预测。

        信号通路研究工具

        一般情况下,信号通路的变化会通过转录水平和蛋白磷酸化水平体现出来,那么这种变化可以用基因芯片、PCR-array、蛋白芯片/磷酸化因子检测,然后用高级分析共表达&IPA,生物信息学的方法进行分析。
        IPA (Ingenuity Pathway Analysis) 是一个一体化的在线整合分析软件,其背后的数据库包含 500 多万条生物学知识。数据经由 500 多名与家多轮质控,收集自 300 多种顶尖杂志的全文、 3000 多种生物学杂志摘要和 30 多个公共数据库,包含人、小鼠、大鼠等物种的基因表达数据、microRNA 数据和小规模实验数据,并且每周更新最新文献,每季度更新分析功能。IPA的分析内容包括:功能疾病相关性分析,生物学下游效应分析,经典通路相关性分析,通路活性效应预测,转录调控分析,转录因子互作分析,相互作用网络分析,生物标志物筛选,功能、疾病背景分子查询,相应文献调研及对应通路绘制等。
        伯豪生物可进行一系列的IPA分析。

        差异基因功能注释流程图




        技术路线



        服务形式

        仅生信分析:
        客户提供每组数据3个或3个以上生物学重复并且为差异基因或者关注的部分基因。
        公司提供图片文件(Network图),包括png、PDF格式;Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;文本文件。
        实验+生信分析:
        客户提供基因信息,疾病信息,活细胞或细胞类型、培养条件信息,及需要进行实验类型。
        公司提供实验报告(材料、试剂、仪器、方法、实验结果)和生信分析结果。


        经典文献:

        Shan-Shan Lai et al., PP2Acα positively regulates the termination of liver regeneration in mice through the AKT/GSK3β/Cyclin D1 pathway. Journal of Hepatology.
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